安徽中医药大学第二附属医院(安徽省针灸医院、安徽中医药大学第二临床医学院)创建于1985年，是全国最早成立、目前也是全国规模最大的集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等针灸专科医院，是国家中医药管理局“中医药国际合作基地”、世界针灸学会联合会“临床基地”、国家中医药管理局“中医药标准化研究推广基地”、中国针灸学会“针灸标准化研究示范基地”，安徽省特色中医院，内设安徽省中医药科学院针灸临床研究所。

医院占地面积18790平方米，建筑面积51500平方米，设有28个临床科室，开放病区25个，医技科室9个，核定床位810张。医院现有在岗职工921人，高级职称189人。拥有全国名中医1人、安徽省国医名师5人，全国名老中医学术经验继承导师9人，各批次国家级名老中医学术经验继承人45人;博士/硕士生导师86人;安徽省江淮名医15人，安徽省名中医20人，安徽省名中药师1人，安徽省政府津贴1人;全国中医药优秀临床人才7人，全国中药优秀传承人才3人，国家中医药管理局“青年岐黄学者培养项目”1人;安徽省学术和技术带头人及后备人选2人，安徽省中医药领军人才及培养对象4人，安徽省卫健委青年领军人才3人;全国中医药创新骨干人才、西学中骨干人才、中医临床技术特色骨干共计5人。国家级临床重点专科带头人4人，国家中医药管理局重点专科带头人8人，省级临床重点专科带头人16人，省级临床重点专病带头人3人。

医院设有脑病、骨伤、推拿、脾胃、老年病、康复、心内、内分泌、呼吸、肿瘤、皮肤、肛肠、妇、男、儿、外、五官、眼、口腔、急诊、麻醉、重症等临床科室及健康管理(治未病)中心，2022年完成脑病、老年病、骨伤和康复“四大中心”布局。拥有卫生部临床重点专科(中医专业)3个、国家中医药管理局重点专科8个，安徽省重点专科专病13个，安徽省“十四五”省级中医特色优势专科3个、重点专病3个;国家中医药管理局重点学科2个，全国名中医工作室1个，全国名老中医工作室7个、安徽省名中医工作室21个。医院有核磁共振成像系统、多层螺旋CT、全自动生化分析仪等先进大型医疗仪器设备16台，拥有中医体质辨识系统、中药煎药包装机、中药制剂设备、中医推拿康复理疗设备等大型仪器。

“十三五”期间，医院承担各级各类科研项目共218项，其中国家级项目4项，安徽省自然基金、安徽省中央引导地方科技发展专项等省部级项目53项、厅局级项目156项，横向合作项目10项。获省部级以上科技奖励15项，国家发明专利3项，实用新型专利13项。开展医院历代名老中医学术经验的整理和挖掘，发表论文130篇，形成专著3项。国家中医医疗服务标准化试点建设项目、中医药研究伦理审查体系(CAP)认证分别通过中期评估和现场审核。获批建设安徽省针灸临床医学研究中心，安徽省针灸临床国际联合研究中心在2020年度绩效评价中获得优秀等次。针药结合防治脑病产业创新团队入选安徽省第十三批“115”产业创新团队。2022年获批国家中医针灸临床医学研究中心分中心。

医院连续多年荣获“安徽中医药大学先进集体”“安徽中医药大学先进基层党组织”“合肥市文明单位”等荣誉称号，2017年8月荣获“全国卫生计生系统先进集体”称号。2019年、2021年分别荣获国家卫生健康委财务司2017-2018年、2020年全国医疗服务价格和成本监测与研究网络“先进机构”称号。2020年获“中国抗疫医疗专家组组派工作表现突出单位”荣誉。2018-2020连续三年在国家三级公立中医医院绩效考核中排名全国同类医院第三，等级A;2021年三级公立医院绩效考核国家监测指标排名全国同类医院第一名，等级为A+。2023年被评为“2020-2021年度国家平安医院建设表现突出集体”，推荐产生十四届全国人大代表1人、安徽省最美医生1人，安徽省优秀护理工作者 1人。